引起新生兒黃疸的原因主要有：生理原因有些胎兒在出生後第2～3日出現黃疸， 第4～6日最重， 隨著肝臟功能的逐漸健全， 黃疸通常在出生後的10～14日消退， 個別有延誤到20日以後者， 屬於生理現象。 血型不合有的胎兒出生24小時以內出現黃疸， 且持續不退。
這種黃疸多是母子血型不合造成的。 當胎兒的血液是RH因數陽性， 而母親的血液是RH因數陰性時， 新生兒易發生溶血而出現黃疸。 此種黃疸較嚴重， 一般不會自然消退， 而需換血、光照療法或輸白蛋白治療。
先天性膽道閉鎖本病是一種少見的先天性畸形， 黃疸乃因胚胎發育異常造成的膽道閉鎖或狹窄，
此病預後惡劣， 應早期手術。 全身性巨細胞性包涵體病本病病源是細胞巨病毒， 由無症狀的帶病毒孕婦通過胎盤感染胎兒。 新生兒在出生一個月內出現黃疸、精神不振、咳嗽、肝脾腫大、消化不良和生長停滯等， 應考慮是本病。
敗血症新生兒因免疫功能不健全抵抗力低下， 易患臍帶感染而發生敗血症， 敗血症可併發中毒性肝炎或肝膿腫而出現黃疸。 新生兒黃疸如超過一個月黃疸不消退， 則應到醫院兒科看病， 以便正確判斷和及時處理。
