藏醫興起于松贊干布至赤松德贊時期, 是在藏族傳統醫學理論的基礎上, 吸收和借鑒漢醫、印度醫學理論而形成的。
藏醫理論認為, 人體記憶體在著“隆”(氣)、“赤巴”(火)、“培根”(土和水)三大因素;飲食精微、肉、血、脂肪、骨、骨髓、精七種物質基礎;大便、小便、汗液三種排泄物。 三大因素支配七種物質基礎和三種排泄物的運行變化。 “隆”主氣血、肢體活動、五官感覺、食物的輸送分解和生殖機能等;“赤巴”可生髮熱能、調解體溫氣色、管饑渴消化、膽識智慧等;“培根”輸送液體、調解肥瘦、主管味覺、睡眠和性格等。 認為人生病的原因在於環境、氣候和飲食起居的影響及體內三大因素的失調。
藏醫理論系統、完整, 醫學典籍眾多。 其中最著名的是西元8世紀宇脫·雲丹貢布所著的《四部醫典》。 該書共分四個部分, 內容從基礎理論到各科臨床實踐, 包括人體解剖、胚胎發育、病因病理、治療原則、臨床各科、方劑藥物、診斷與治療器械等等,