嚴重缺氧和混合型酸中毒使肺動脈痙攣或其肌層增生（長期低氧血症）， 使肺動脈阻力增高， 右心壓力增加， 導致卵圓孔水準的右向左分流；同時有可使處於功能性 關閉或未閉的動脈導管重新活保持開放， 導致導管水準的右向左分流。 使低氧血症和混合型酸中毒進一步加重， 形成惡性循環， 即新生兒持續肺動脈高壓。 那麼新生兒肺動脈高壓的危害有哪些呢？
（1）肺動脈高壓的危害之缺氧：血液由右心室向肺內流動的阻力增加， 肺內血液減少， 血液從肺內攝取的氧氣減少， 而不能滿足人體的需要，
（2）肺動脈出現高壓的危害之右心功能不全：血液由右心室向肺內流動的阻力增加， 使右心室負擔增加， 可以引起右心室肥大和功能不全， 出現下肢水腫、肝大、腹水、肝硬化和消化不良。
（3）肺動脈出現高壓的危害之三尖瓣關閉不全和房顫：隨著肺動脈壓力的增高和右心室右房的增大， 可以逐漸引起三尖瓣關閉不全和心房纖顫， 進一步加重心功能不全。
（4）肺動脈高壓的危害之增加治療的難度和風險：發生重度肺動脈出現高壓後， 特別是出現呼吸功能不全和紫紺者， 治療引起肺動脈出現高壓疾病的難度和風險增加， 使原本可以通過簡單手術治癒的疾病（如室間隔缺損、房間隔缺損和瓣膜置換）喪失完全康復或手術機會，
（5）肺動脈高壓的危害之容易發生感冒、肺炎：無論是肺動脈血液過多， 還是肺靜脈淤血等， 都可以損害肺組織， 加之心功能不全全身抵抗力下降， 而容易發生感冒肺炎和發熱， 並且往往比較頑固而難以治癒， 而肺部炎症又反過來加重肺動脈的高壓危象。
（6）肺動脈高壓的危害之生長發育不良：由於缺氧、心功能不全和經常感冒肺炎， 患者往往食欲差、營養狀況下降， 消瘦， 在兒童表現為體重不增， 生長發育落後于同齡孩子。
