肛瘺的中醫治療其治療方法， 可以歸納為消、托、補三大法則， 臨床上應根據病情不同而靈活運用。 如在治療肛門直腸癰疽中， 可根據其發病過程中的不同階段， 分別以消、托、補三法治療， 這是運用這一治療總則的典型。
內治法的三個總則
消法：
這是用消散的藥物， 使初起的肛周癰疽和炎性外痔等得到消散， 免受潰膿和切開之苦。 此法適用于沒有成膿的肛周癰疽、炎性外痔、血栓外痔和肛裂等病。 但具體用法是極其靈活的， 因為各種疾病的病因不同， 病的性質也各不相同， 所以， 治療方法也必須因病而異。
如有表邪者宜解表， 裡實者宜通裡， 熱毒蘊結者應清熱解毒， 寒邪凝結者應溫通， 氣滯者要行氣， 血瘀者要活血化瘀等。 同時， 還需根據病人體質的強弱， 癰疽所屬的不同經絡， 靈活施治。
凡未成膿者， 可以內消， 即使不能內消， 也可移深出淺， 轉重為輕；如膿已成， 則不可用內消之法， 以免養膿為患， 毒散不收， 血氣受損， 膿毒內蘊， 反會侵蝕好肉， 潰爛後難於收斂。
托法：
這是用補益氣血的藥物， 扶助正氣， 托毒外泄， 以免毒邪內陷。 此法適用于肛周膿腫中期， 正氣虛弱， 毒邪偏盛， 不能托毒外透， 肛周癰疽外形平塌， 根腳散漫， 難潰難腐的虛證。 如毒氣盛而正氣未衰者， 可用透膿的藥物， 促其早日泄出膿毒， 腫消痛減， 以免膿毒旁竄， 造成後患。
補法：
這是用補益的藥物， 恢復正氣， 助養患處新生， 使瘡口、瘺口早日癒合。 此法適用於老年體虛， 氣血虛弱， 潰瘍後期， 或肛腸疾病術後， 熱毒已去， 病灶巳除， 而精神衰疲， 元氣虛弱， 膿水清稀， 瘡口難斂者， 以及便血和脫垂等病人。
凡氣血虛弱者， 宜補養氣血， 凡脾胃虛弱者， 宜理脾和胃， 凡肝腎不足者， 宜補養肝腎等。 但在毒邪未盡的時候， 切勿早用補法， 以免病邪內蘊， 久而為患。
