口腔潰瘍是日常生活中的常見症狀， 一個人一生中或多或少會碰到。 有不少藥物也可以誘發或直接導致口腔潰瘍的發生， 像抗腫瘤藥物， 如甲氨蝶呤、環磷醯胺、阿黴素等。
抗生素氨苄西林、頭孢氨苄、甲硝唑及替硝唑等， 可誘發口腔變態反應而產生潰瘍。
柳氮磺吡啶， 目前廣泛用於治療潰瘍性結腸炎、類風濕性關節炎、銀屑病和結節性紅斑等疾病。 它也可引起口腔漬瘍。
抑制胃酸分泌的藥物， 如奧美拉唑、西咪替丁， 在用藥4—5天后， 患者可出現口幹、口腔黏膜糜爛等症狀， 其機制可能與其。 在抑制胃酸分泌的同時影響了唾液腺的分泌有關。
解熱鎮痛藥物， 如阿司匹林、雙氯芬酸鈉， 都有引發口腔潰瘍的報導。 以阿司匹林腸溶片為例， 它是有機弱酸， 對黏膜有刺激作用， 而口腔黏膜血運豐富， 常規服用阿司匹林可導致黏膜損傷。 若患者口腔黏膜對該藥特別敏感， 即使是小劑量， 也可造成口腔黏膜潰瘍。
此外， 某些減肥藥， 如鹽酸西布曲明（商品名：曲關）是一種治療肥胖症的藥物， 作用於中樞系統， 使人增強飽腹感， 減少進食。 有報導稱， 有患者口服西布曲明7～12天后， 出現口腔疼痛、潰瘍。 其原因可能與藥物抑制食欲，
一些潤喉藥， 如含有薄荷成分的喉片。 具有收縮口腔黏膜血管、減輕炎症水腫和疼痛的作用， 開始使用的時候感覺清涼舒適， 有效緩解咽部疼痛;不過， 在口腔無炎症時經常含服， 會因黏膜血管收縮、黏膜乾燥破損， 導致口腔潰瘍的發生。
