糖尿病的病因目前認為與遺傳因素、自身免疫、微血管病變、神經病變的發生及紅細胞C3b受體的降低及清除迴圈免疫複合物能力的降低有關。 有些對胰島素無反應的糖尿病患者產生了抗胰島素受體的自身抗體, 胰島素與受體的結合被阻斷, 其免疫學發病機理又與重症肌無力相似, 且在糖尿病或其親屬中常伴有自身免疫性疾病, 如伴有惡性貧血、甲亢、橋本病、原發性甲減及重症肌無力等, 近親中有抗臟器抗體、抗甲狀腺細胞及抗胃壁細胞抗體、抗胰島細胞抗體等, 均示糖尿病也與自身免疫有關。
糖尿病累及神經系統臨床上常見, 但一般血糖控制後, 神經系統症狀可減輕。 臨床上糖尿病合併重症肌無力在國內罕見報導, 兩者是否有因果關係尚待進一步探討。 有人推測胸腺細胞中存在著能引起肌無力的抗原, 這種抗原可能是病毒。 而糖尿病人抵抗力低易受病毒感染, 繼發胸腺內抗原-抗體反應, 阻斷了神經興奮性的傳導並產生重症肌無力。