再生障礙性貧血患者在造血幹細胞移植後可能出現多種併發症, 患者在術後的觀察期需要密切觀察併發症的跡象, 並及時檢查治療併發症。 間質性肺炎是造血幹細胞移植後的一個較重的併發症, 其發生與放射照射、病毒感染、卡氏肺囊蟲感染、移植物抗宿主病等有關。
間質性肺炎的發生與全身照射劑量, 尤其與肺組織的吸收射線劑量過大有關, 如果在照射過程中採用肺遮罩或選用低照射劑量率減輕肺組織的損傷。 再障患者免疫力低下, 在接受預處理時的大劑量放化療和移植後的免疫抑制劑治療後,
接受移植後伴發間質性肺炎的患者可出現輕到中度咳嗽、乾咳或有少量痰液, 呼吸急促, 口唇發紫, 出現進行性呼吸困難, 多數患者有發熱和肺部囉音。 患者可應用抗病毒藥物預防病毒感染, 用磺胺類藥物預防卡氏肺囊蟲感染。