一、種植學說:子宮內膜碎片隨經血逆流, 通過輸卵管進入盆腔而種植於卵巢或盆腔其他部位所致。 臨床上在月經期行剖腹探查時可在盆腔中發現經血, 且經血中查見子宮內膜。
二、淋巴及靜脈播散學說:盆腔的淋巴管、淋巴結核靜脈中發現有子宮內膜組織, 因而提出子宮內膜可通過淋巴或靜脈播散到腹膜等組織。
三、體腔上皮化生學說:盆腔腹膜或卵巢生髮上皮都是由具有高度化生潛能的體腔上皮分化而來的, 在炎症或卵巢激素的持續刺激下, 腹膜或卵巢生髮上皮可轉化為子宮內膜。
四、免疫學說:在月經來潮時有經血經輸卵管逆流至腹腔, 少數發生在盆腔子宮內膜異位症。 異位內膜周圍有淋巴細胞、漿細胞浸潤, 巨噬細胞內含有鐵血黃素沉著及不同程度的纖維化。 由於異位內膜病灶做為異物, 啟動了機體的免疫系統所致。