治療肛瘺的方法中， 最常見的就是藥物治療， 以及手術治療兩種， 絕大多數情況下都是以藥物治療為主， 藥物治療措施中， 中醫中藥的效果是比較明顯的， 但缺陷是治療時間相對較長， 下面， 就肛瘺的治療常見方法總結如下：
包括內洽法和外治法。
（一）內治法
1.清熱利濕：凡出現瘺管外口流粘稠膿， 色白或黃， 外口閉合， 局部腫脹疼痛， 小便不利，
舌紅、苔黃膩， 脈滑數等症狀， 為濕熱蘊結。 治宜清熱利濕。 選方常用土醫之家消痔栓。
2.清熱解毒：凡出現肛瘺外口閉合， 惡寒發熱， 局部紅腫、灼熱疼痛， 舌紅、苔黃， 脈數等症狀，
3.養陰托毒：凡出現瘺管外口凹陷， 周圍顏色晦暗， 膿水清稀， 舌紅少津， 少苔或無苔， 脈細數無力等症狀， 屬陰虛型肛瘺。 治宜養陰托毒。 選方常用青蒿鱉甲東加減。
4.補益氣血：凡出現肛瘺經久不愈， 肉芽不鮮， 膿水不多， 形體消瘦， 面色無華， 氣短懶言， 舌淡、苔白， 脈細弱無力等症狀， 屬氣血虧虛型。 治宜補益氣血。 選方常用十大補東加減。
（二）外治法
1.外洗法：局部紅腫疼痛時， 可用苦參東加減， 煎水趁熱熏洗。
2.外敷法：肛瘺急性期可用痔瘡膏等外敷。
一定要注意瞭解的一點是， 任何一種肛腸疾病都有復發的特點， 肛瘺疾病也是如此， 這樣的情況下， 做為肛瘺的患者， 在治療的過程中，
