紅斑狼瘡可累及身體各臟器， 尤其是皮膚、腎、造血系統、關節、心血管系統。 患者可有發熱、疲倦、厭食等全身症狀。 亦常有淋巴結腫大， 但多質軟、無壓痛。
1.皮膚黏膜 除了盤狀紅斑、蝶型紅斑等特異性皮損外， 還可有甲周紅斑、光暴露部位水腫性紅斑， 以及風團、丘疹、瘀點、瘀斑、水皰、糜爛、潰瘍、壞死等白細胞碎裂性血管炎的症狀及體征。 常見的皮膚表現還有口腔潰瘍、脫髮（彌漫性脫髮或前額斷發）與雷諾現象。 後者為遇冷後手指（足趾）變白、變紫、疼痛。
2.骨關節系統 可呈遊走性關節炎或進行性多發性關節炎。
3.腎 表現為腎炎或腎病綜合征， 又稱“狼瘡腎”。 患者可有血尿和（或）蛋白尿。 尿常規檢查可見紅細胞、臼細胞、蛋白， 甚至管型。 腎炎嚴重者可因腎衰竭而死亡。
4.心血管系統 可有心包炎、心肌炎和心內膜炎以及各種類型的心律失常。 其中以心包炎和心律失常相對多見。 亦可見動、靜脈炎， 如血栓閉塞性脈管炎及脈炎。
5.造血系統 可有貧血、白細胞減少、血小板減少。 自身免疫性溶血性貧血是貧血的一個重要原因。 白細胞減少主要是粒細胞和淋巴細胞的減少， 淋巴細胞的減少與病情活動性相關。
6.呼吸系統 主要表現為胸膜炎與間質性肺炎的症狀和體征， 如胸悶、胸痛、咳嗽等， 應與繼發感染相區別。
7.消化系統 各種症狀和體征是消化系統血管炎的結果， 表現為厭食、噁心、嘔吐、腹痛、腹瀉、便血等。 部分患者有肝脾大。
8.精神神經系統 可有各種精神障礙， 如欣快、淡漠、幻覺、躁動、妄想等。 中樞神經系統受累時可有顱內壓增高、腦炎、腦膜炎、蛛網膜下腔出血及各種腦血管以外的表現， 如頭痛、嗜睡、驚厥、頸強直、偏癱、昏迷等。
