卵巢囊腫手術要根據患者的實際情況來決定是否需要進行， 這主要是和囊腫的大小有關， 對於比較小的囊腫， 還是推薦保守治療方法， 而不是馬上進行卵巢囊腫手術。
宮內膜異位症的病灶發生在卵巢上亦可形成囊腫， 因囊腫內含有暗褐色粘糊狀陳舊血， 似巧克力， 故也稱卵巢巧克力囊腫， 它通常表現為痛經， 隨著每次月經來潮， 囊腫內血液逐漸增加， 囊腫逐漸增大， 有時甚至破裂。 卵巢囊腫有雖不是腫瘤， 但由於有痛經亦影響生育， 患者常常很痛苦， 故一旦懷疑卵巢囊腫， 宜儘早就醫藥物治療及卵巢囊腫手術。
卵巢腫瘤分良性與惡性， 良性腫瘤通常表現為單側囊腫、活動、表面光、生長緩慢。 惡性腫瘤表現為雙側性或單側性， 實性或囊實性， 表面高低不平， 但有時良惡性腫瘤在臨床上很難區分， 必須手術後經病理檢查才能最後區分， 所以一旦懷疑為腫瘤宜儘早進行卵巢囊腫手術。
以上情況就是需要卵巢囊腫手術的時機， 雖然卵巢囊腫是一般都是良性的， 不會造成患者很大的痛苦， 但是介於卵巢囊腫對女性不孕的重大影響以及較大的癌變幾率， 還是需要多加關注卵巢囊腫手術的。
