嬰兒在出生以後， 一方面來自母體的雄激素會使肛腺分泌較為旺盛， 如果是男嬰的話， 其自身睾丸所產生的雄激素會使皮脂腺及肛腺的分泌情況更為旺盛， 一旦發生感染， 嬰兒就很容易患肛周膿腫， 轉變為肛瘺的可能也極高。
另一方面， 嬰兒肛瘺的發病還與其肛管局部的免疫功能不全有關。 嬰兒肛門直腸部粘膜的局部免疫結構尚未成熟， 肛隱窩具有易感性， 比較容易導致肛瘺的發生， 因此嬰兒期發生 肛瘺也很常見。 嬰兒長到一歲多以後， 由於自身免疫功能的提高和旺盛的雄激素水準發生生理性下降，
據國內外統計， 嬰幼兒肛瘺在出生後6個月以內發病者占小兒肛瘺的2/3;在生後3個月內發病率最高， 也就是出生後3個月的嬰兒， 以及未滿1周歲的幼兒， 也會出現肛門腫痛、化膿的情況。
男性多於女性， 男性占80%—90%， 嬰幼兒肛瘺發病部位多在肛門兩側， 瘺管多呈淺在、單純、垂直。 複雜而瘺深的較少， 排膿後症狀可很快減輕， 並多數可自愈， 有部分患兒未治可自愈， 待成人後可再發。
治療時應對症， 根據三個不同階段採用不同的治療方法：
①膿腫未成
僅見皮下有炎症反應時；可採用保守治療， 每日用溫開水坐浴2—3次， 適當吃些抗生素， 局部可用金黃如意膏外敷等消炎、消腫治療。
②膿腫已成
切開排膿， 預防反復感染， 由於距肛竇較近， 可一次切至肛竇， 可避免日後成肛瘺。
③ 一旦肛瘺已形
可等孩子稍大些， 到5—10歲時再手術， 可行瘺道切開術或掛線治療。 如在肛門兩側同時存在兩個瘺道者， 應分次行瘺道切開術， 若採用掛線方法， 可用膠線一次收緊即可。
