新生兒敗血病的症狀因病菌的種類、數量、毒力、小孩的抵抗能力不同而有差異。 常見者有金黃色葡萄球菌、溶血性鏈球菌、肺炎鏈球菌、大腸桿菌、腦膜炎雙球菌、綠膿桿菌、變形桿菌、沙門菌屬、克雷白菌屬等引起的。 近年來致病菌種已發生變化， 由革蘭陽性球菌引起的敗血症有所下降， 而革蘭陰性桿菌、厭氧菌和真菌所致者逐年上升， 這與血管插管、體內異物置人等醫學新技術的開展和抗生素的過度應用有一定關係。
新生兒敗血症的早期臨床表現常不典型， 早產兒尤其如此。 表現為進奶量減少或拒乳，
1、感染中毒症狀。 大多起病急驟， 先是畏寒怕冷， 然後突然高熱， 熱型不定， 弛張熱或稽留熱；體弱、重症營養不良和小嬰兒可無發熱， 甚至體溫低於正常。 另外， 四肢末梢厥冷， 呼吸急促， 心率加快， 血壓下降， 嬰幼兒還可出現黃疸。
2、皮膚損傷。 部分患兒可見各種皮膚損傷， 以瘀點、瘀斑、猩紅熱樣皮疹、尊麻疹樣皮疹常見。 腦膜炎雙球菌敗血症可見大小不等的瘀點或瘀斑；猩紅熱樣皮疹常見於鏈球菌、金黃色葡萄球菌敗血症。
3、胃腸道症狀。 常有嘔吐、腹瀉、腹痛， 甚至嘔血、便血；嚴重者可出現中毒性腸麻痹或脫水、酸中毒。
4、關節症狀。 部分患兒可有關節腫痛、活動障礙或關節腔積液， 多見於大關節。
5、肝脾腫大。 以嬰、幼兒多見， 輕度或中度腫大；部分患兒可併發中毒性肝炎；金葡菌遷徙性損害引起肝臟膿腫時， 肝臟壓痛明顯。
6、其他症狀。 重症患兒常伴有心肌炎、心力衰竭、意識模糊、嗜睡、昏迷、少尿或無尿等實質器官受累症狀。 金黃色葡萄球菌敗血症常見多處遷徙性病灶；革蘭陰性菌敗血症常併發休克和DIC。 瘀點、瘀斑、膿液、腦脊液、胸腹水等亦可直接塗片、鏡檢找細菌。
