現在約翰霍普金斯大學的研究人員認為一些頭頸部的癌症， 尤其是扁桃體的和舌以下區域的癌症同HPV感染有關。 他們還發現HPV陽性的頭頸部癌症的預後比較好， 說明與其它的頭頸部癌症不同。
Keerti V. Shah博士說， 通常頭頸部癌症的預後不太好， 大多數病人是在疾病晚期才發現的。 但HPV陽性的癌症在顯微鏡下有明顯的特徵， 所以病理學家能立即判斷是否是HPV陽性的腫瘤。
在5月3日出版的國立癌症研究所雜誌上， Shah博士及其同事發表了他們的研究報告。 他們在253例頭頸部癌症的病人中檢測HPV。 25%的病例中發現HPV， 90%的HPV陽性腫瘤中還帶有HPV16亞型，
HPV陽性的腫瘤同HPV陰性的腫瘤有明顯的區別。 一方面在顯微鏡下有明顯區別， 另一方面HPV陽性腫瘤很少有P53基因的突變。 在中重度飲酒者和吸煙者中， HPV陽性腫瘤要比其它類型的頭頸部腫瘤少。 根據這些特徵， 研究人員認為這種癌症可能同HPV感染有關。
HPV陽性腫瘤患者同其它腫瘤患者相比， 死於癌症的可能性要少59%。 這可能是HPV破壞組織的能力不如一些環境因素， 如吸煙。 另外， HPV陽性腫瘤對放療更敏感。
在一篇評論中， 哈佛大學的David T. W. Wong和Karl Munger博士認為高危的HPV相關的頭頸部癌症可能同HPV相關的子宮頸癌相似但不等同。 他們認為這一發現很有價值， 因為這對頭頸部癌症患者的診斷和治療都有重要的意義。
