新生兒腋溫超過37.2℃或肛溫超過37.8℃時即為發熱（fever）， 進一步應明確發熱的原因， 首先除外各種感染病因， 根據病史， 臨床表現和實驗室檢查， 一般容易診斷新生兒發熱原因， 但首先應準確測量體溫。 常規作胸片， B超， 心電圖等檢查， 除外肺部感染， 除外神經系統病變等， 必要時做腦電圖， CT等檢查。
一、新生兒發熱的檢查診斷：
測量新生兒體溫常用部位是肛門， 腹部皮膚和腋下， 通常將肛溫視為深部體溫， 測肛溫時溫度探頭插入深度為3cm， 測肛溫的缺點是偶可引起腸穿孔， 這種情況極少見， 如操作謹慎輕柔， 完全可避免，
測量腋溫的優點是對新生兒干擾很小， 受外界影響也小， 兼有肛溫和皮溫的優點， 因此， 臨床上通常以測腋溫作為新生兒體溫監護， 腋溫接近深部體溫， 一般情況下較肛溫低， 若機體受寒冷刺激， 棕色脂肪分解增加， 此時腋溫偶可比肛溫高。
測量體溫的間隔時間需視新生兒體溫是否穩定和所使用的方法而定， 如用熱敏電阻為探頭的電子體溫計， 溫度探頭可固定在新生兒身體某一部位作為體溫監護， 隨時可從數位螢幕上得知體溫讀數，
二、新生兒發熱的症狀
1、發熱程度分級：
（1）低熱：37。 5℃-38℃
（2）中等熱：38。 1℃-39℃
（3）高熱：39。 1℃-40℃
（4）超高熱：40℃以上
2、經過細緻的體格檢查， 根據一些體征能説明找到小兒高熱的誘因， 主要有以下幾個方面：
（1）若患兒皮膚出現皮疹， 可能為常見的出疹性傳染病， 例如幼兒急疹、麻疹、風疹等；
（2）若發現皰疹， 可能為水痘；
（3）若發現皮膚有瘀斑， 應考慮流行性腦脊髓膜炎， 亦應考慮血液系統疾病；
（4）若發現淺表淋巴結腫大， 應考慮傳染性單核細胞增多、皮膚黏膜淋巴結綜合征， 亦應該注意白血病和惡性淋巴瘤；
（5）若發現咽部充血、扁桃體腫大，
（6）若發現口腔粘膜有斑點， 可能為麻疹；
（7）若肺部聽診聞及痰鳴音或水泡音， 是急性支氣管炎或支氣管肺炎的體征， 肺部聽診有哮鳴音， 應考慮喘息樣支氣管炎或支氣管哮喘；
（8）腹部有明顯的壓痛或其它體征， 應注意急腹症， 如急性闌尾炎、腸梗阻等。
三、新生兒發熱機制
1、體溫調節中樞功能不完善
新生兒體溫調節功能不完善， 產熱與散熱易失去平衡， 故體溫容易波動。
2、汗腺發育不完善
早產兒沒有排汗功能， 體溫隨環境溫度升高而升高， 足月兒用排汗的方法來維持體溫（出汗在前額頭上）， 新生兒雖有汗腺組織， 但發育不完善， 對熱的反應強度僅及成人的1/3，
3、環境溫度過高
環境溫度過高時新陳代謝率及氧的消耗增加， 不顯性失水增加， 新生兒在熱環境下皮膚血管擴張， 血流速度增快， 加速輻射和對流作用， 促進身體散熱， 當環境溫度增至30℃以上， 或腋溫升至37.2℃時， 新生兒開始出汗， 汗珠先出現在前額， 兩側鬢角， 以後在胸部， 足月兒大腿內側也可微微出汗， 若不注意補充水分可致脫水和高鈉血症。
四、新生兒發熱的鑒別診斷：
1、發熱由疾病引起還是環境因素引起
發熱由疾病引起還是環境因素引起有時很難區別， 測定深部體溫和周圍體溫之差如肛溫-指（趾）溫差， 有助於區別， 當環境溫度過高時， 新生兒周圍血管擴張， 肛溫與周圍體溫差減少；由疾病引起的發熱， 周圍血管收縮， 肢體變冷， 增加了肛溫與周圍體溫差， 如深部溫度與周圍溫度差超過1.6℃， 提示發熱由疾病引起。
2、新生兒脫水熱
應注意與圍生期細菌或病毒感染以及顱內出血引起的發熱區別， 脫水熱表現為發熱， 煩躁， 哭鬧， 尿少， 皮膚潮紅；將患兒置於低溫度環境中， 補充水分後體溫即可降至正常。
