治療肺膿腫病期在三個月以內者， 應採用全身及藥物治療。 包括抗生素全身應用及體位元引流， 局部滴藥、噴霧及氣管鏡吸痰等。 經上述治療無效則考慮外科手術治療。
手術適應症：
1、病期在三個月以上， 經內科治療病變未見明顯吸收， 而且持續或反復發作有較多症狀者。
2、慢性肺膿腫有突然大咯血致死的威脅， 或大咯血經積極藥物治療仍不停止者， 應及時手術搶救。
3、慢性肺膿腫如因支氣管高度阻塞而感染難以控制者， 應在適當準備後進行肺切除。
4、慢性肺膿腫與其他病灶並存， 或不能完全鑒別，
術前準備：包括改善病人全身情況， 加強營養， 間斷輸血， 全身用抗生素， 體位元排痰， 局部噴霧， 氣管內滴藥等。 經住院3～6周準備， 痰量減少至每天50ml以下；痰由黃膿稠變為白粘稀薄；食欲、體重有所增加；血紅蛋白接近正常， 體溫脈搏趨於平穩， 則可進行手術。
手術範圍：肺膿腫的手術難度大、出血多， 病變往往跨葉， 手術範圍不宜太保守， 盡可能不做肺段或部分肺葉切除， 而多數是超過肺葉範圍， 甚至需要全肺切除。
手術併發症：常見的有失血性， 支氣管瘺及膿胸、吸入性、食管瘺等。
其預後， 大多數慢性肺膿腫經外科治療療效滿意， 症狀消失， 並恢復正常工作。
