乙肝治療如何選擇方案需要根據病人的身體狀況來定制， 目前認為對慢性乙肝應採取綜合治療：抗病毒、免疫調節、改善肝功能和抗肝纖維化等， 如何有效的進行乙肝抗病毒治療是乙肝能不能治好的關鍵。 乙肝抗病毒治療目前應用的有α干擾素、核苷類藥物和免疫調節劑如胸腺肽製劑等， 但療效均不夠滿意， 治療後乙肝病毒難以徹底清除， 復發率較高。
影響乙肝抗病毒療效的主要原因是乙型肝炎病毒（HBV）共價閉合環狀DNA（cccDNA）難以徹底清除和人體對HBV的免疫耐受所致。 所以， 抗病毒的同時進行免疫調節，
在乙肝治療時， 乙肝病毒異變也會降低抗病毒的效果。 乙肝病毒異變可以造成免疫逃逸， 病毒不易清除;同時病毒變異後， 可引起耐藥， 均可降低乙肝抗病毒的療效。 乙肝治療如何防止病毒異變讓很多專家頭疼， 所以應選擇適當方案， 避免異變的發生。
