1、卵巢黃體期缺陷。 觀察到部分患者黃體期≤10天， 子宮內膜定期病理檢查黃體期缺陷， 其黃體缺陷的發生率據報導為25%-40%。 黃體功能不全不但降低受孕率， 同時增加自然流產率。
2、子宮內膜異位可伴隨不排卵。 據報導子宮內膜異位元症有17%-27%不排卵， 其機制和患者卵泡細胞的LH受體少有關。
3、腹水中前列腺素（PGF2a）分泌增高與不孕。 研究發現患者腹水中前列腺素濃度較正常人高。 前列腺素的增高可影響卵泡的成熟並造成黃體功能不足。 此外， 腹水中的前列腺素的增加， 可使輸卵管痙攣、節律運動異常及使孕卵發育與蛻膜變化不同步，
4、腹水中白介素Ⅰ及Ⅱ增高與不孕。 白介素Ⅰ是巨噬細胞產生的一種特異蛋白， 能誘導T細胞分化、增殖並產生白介素Ⅱ， 還能刺激前列腺素合成， 使纖維細胞增加， 活化及細胞產生免疫球蛋白的功能。 異位症患者腹水存在白介素Ⅰ及白介素Ⅱ， 並隨疾病的嚴重而增加。
5、黃素化卵泡不破裂綜合征（LUF）。 即指卵泡黃素化而無排卵、卵泡成熟並黃素化而形成黃體， 但成熟的卵子並不破出黃體而進入腹腔。 雖然血清內孕激素濃度增加、基礎體溫雙相， 子宮內膜呈分泌期改變， 但腹腔鏡下在卵巢黃體上見不到排卵後的破孔。 腹水內孕激素含量也顯著低於正常。 據報導子宮內膜異位元症中， LUF的發生率可高達75%，
6、腹水的量、成分與不孕。 患者的腹水量為10-20ml， 而正常人
