正常婦女不孕率約為15%, 內膜異位症患者可高達40%。 重度子宮內膜異位患者不育的原因可能與盆腔內器宮和組織廣泛粘連和輸卵管蠕動減弱, 以致影響卵子的排出、攝取和受精卵的運行有關。 但盆腔解剖無明顯異常的輕症患者亦可繼發不育的原因絕非單純局部解剖異常所致。 現多認為異位內膜患者的不育還可能與以下因素有關:
(1)黃體期功能不足:內膜異位症患者卵泡和黃體細胞上的lh受體數量較正常婦女為少, 以致黃體期黃體分泌不足而影響受孕。
(2)黃素化未破裂卵泡綜合征為卵巢無排卵,
(3)自身免疫反應:內膜異位症患者體內b淋巴細胞所產生的抗子宮內膜抗體可干擾早期受精卵的輸送和著床, 腹腔內巨噬細胞增多亦可吞噬精子和干擾卵細胞的分裂從而導致不孕。