一、性激素療法:由於妊娠和閉經可避免發生痛經和經血逆流, 並能導致異位內膜萎縮退化, 因此, 性激素已成為臨床上治療內膜異位症的主要非手術療法, 但對較大的卵巢子宮內膜異位囊腫, 特別是診斷尚未十分確定者或肝功能異常者均忌用性激素治療。
二、隨訪觀察:適用於病變輕微、無症狀或症狀輕微患者, 一般可每數月隨訪一次。 對希望生育的患者, 應作有關的各項檢查如輸卵管通液試驗或子宮輸卵管造影, 特別是在腹腔鏡檢查下行輸卵管通液試驗, 必要時解除輸卵管粘連扭曲,
三、手術治療:根據手術範圍的不同, 可分為保留生育功能、保留卵巢功能和根治性手術三類。