在不孕婦女中， 約15%～20%患子宮內膜異位症， 而在子宮內膜異位症病人中， 不孕率約30%～40%。 那麼， 為什麼會發生不孕呢？ 異位的子宮內膜與行經一樣， 發生週期性出血， 血液不能外流， 刺激盆腔腹膜， 發生粘連， 形成疤痕， 使輸卵管受壓梗阻；或使輸卵管漿膜粘連成束、扭曲， 從而影響攝取卵子的作用；或因粘連， 子宮後傾固定， 使精子不易進入子宮口；或因粘連包繞卵巢， 卵子排不出；或因子宮內膜異位囊腫 （又稱巧克力囊腫）， 異位於卵巢內的內膜病灶破壞了卵巢實質， 影響排卵。 以上種種原因， 均可造成不孕。 另外， 隱性子宮內膜異位症（指盆腔腹膜上散在著點狀或小片狀的異位子宮內膜，
因為：①異位的子宮內膜產生的前列腺素， 顯著高於正常的子宮內膜， 過高的前列腺素可阻止卵泡增長， 影響輸卵管的蠕動而影響受孕；還可促成黃體退化， 易導致流產。 ②異位內膜週期性出血， 不能外流， 機體巨噬細胞進行吞噬吸收， 從而誘發自身免疫反應， 如血清抗卵巢抗體、抗子宮內膜抗體升高， 影響排卵和黃體功能， 影響孕卵著床。 ③部分子宮內膜異位元症病人可引起血清催乳素增高， 抑制FSH分泌， 使卵泡發育不良， 導致不排卵或黃體功能不全而不孕。
