卵巢囊腫在早期並無明顯的臨床表現， 患者往往因其他疾病就醫在行婦科檢查時才被發現， 以後隨著腫瘤的生長， 患者有所感覺， 其症狀與體征因腫瘤的性質， 大小， 發展， 有無繼發變性或併發症而不同。
卵巢囊腫有良性、惡性、交界性之分， 不是所有的囊腫都需要手術治療。 一般來說， 良性囊腫如濾泡囊腫大都在5釐米以下3釐米左右， 此時應觀察三個月， 若兩個月左右的時間內濾泡囊腫縮小或未增大， 那麼過一段時間後囊腫便會自行消失， 這種情況無需手術。 但若囊腫繼續增大（大於5釐米）就必須手術治療了。
卵巢囊腫是一種非常常見的卵巢良性腫瘤， 有生理性囊腫和病理性囊腫之分， 生理性囊腫如黃素囊腫， 與月經週期和妊娠等有關， 無需用藥， 多數會自行消失， 更不需要手術治療。
病理性囊腫常見的有畸胎瘤、黏液性或漿液性囊腫， 以及由子宮內膜異位症引起的巧克力囊腫等， 這種病理性的囊腫長到一定大小， 會發生蒂扭轉、破裂、感染， 有一定的惡變率， 而一旦發展為卵巢癌， 治療起來就比較困難， 而且轉移率很高， 所以， 病理性卵巢囊腫患者應引起重視， 及時治療。
