目前可治療尖銳濕疣的方法有很多， 主要包括：冷凍治療、鐳射治療、微波治療、電燒灼、手術治療等。
1、冷凍治療。 冷凍治療最大好處是局部不留痕跡， 治癒率約70%， 可分噴霧法或直接冷凍法， 以液氮或二氧化碳乾冰冷凍皮膚的病損， 使疣體損害局部水腫、壞死， 以達到治療的目的。 適用於平坦較小的疣體。
2、鐳射治療。 特點是見效快， 治療後疣體可馬上脫落。 常用的是二氧化碳鐳射， 燒灼疣體。 但由於鐳射光束的過於集中， 鐳射治療只適用於較小疣體的尖銳濕疣。 在疣體較大時， 鐳射治療的復發率相對較高。
3、微波治療。 90年代後興起的治療方法。 它的原理是利用微波的高頻震動， 使疣體內部水分蒸發， 壞死後脫落。 特點是不易復發， 但創面恢復較慢， 容易引起繼發感染。 所以微波治療特別適用於治療較大、孤立和散在的疣體。
4、電燒灼治療。 一種比較老的治療方法。 常用高頻電刀或電烙鐵燒灼尋常疣、色素痣及其他皮膚贅生物。 特點是操作簡單有效， 但其瘡面的癒合較緩慢。 高頻電刀可直接切除和乾燥疣體， 治療徹底。 電燒灼治療可用於任何尖銳濕疣的治療， 但是對施術者的技術要求較高， 燒灼太過或不足都是有害的。
5、手術治療。 一般情況尖銳濕疣一般不主張手術治療， 手術治療後尖銳濕疣很容易復發。 但對於疣體較大的患者也可考慮手術治療，
