尿道口尖銳濕疣一般依靠藥物治療， 如抗病毒藥和足葉草脂， 具體治療方法如下：
抗病毒藥
5%酞丁胺霜劑， 或用0.25%皰疹淨軟膏， 每日2次， 外塗；無環鳥苷口服， 每日5次， 每次200mg；無環鳥苷軟膏外用；α-干擾素每日注射300萬單位， 每週用藥5天， 或者干擾素300萬單位注入疣體基部， 每週2次。
淨腐蝕劑或消毒劑
30%-50%三氯醋酸或飽和二氯醋酸， 或18%過氧乙酸。 用10%水楊酸冰醋酸或40%甲醛、2%液化酚、75%乙醇蒸餾水100ml混合溶液， 塗於患處， 每日或隔日1次。 消毒劑可用20%碘酊外塗， 或2.5-5%碘酊注射於疣體基部， 每次0.1-1.5ml， 也可用用新潔爾滅外塗或以0.1-0.2%外敷。
足葉草脂
用20%足葉草脂酊劑塗于皮損處或用藥前，
先有油質抗菌藥膏保護皮損周圍的正常皮膚或黏膜，
然後塗藥，
用後4-6小時，
用30%硼酸水或肥皂水清洗，
必要時3天后重複用藥，
該藥對組織破壞性大，
使用不當可引起局部潰瘍。
副作用主要表現為噁心、腸梗阻、白細胞及血小板減少，
心動過速、尿閉或少尿，
使用時必須謹慎，
發現上述反應時，
應立即停藥。
