子宮肌瘤易與下列情況或疾病相混淆， 應注意鑒別。
一、妊娠子宮
子宮肌瘤併發囊性變時， 易誤診為妊娠子宮；而妊娠子宮， 特別是40歲以上高齡孕婦， 或過期流產而有流血者， 也可能誤診為子宮肌瘤。 臨床上遇見育齡婦女而有停經史者， 應首先想到妊娠之可能， 經B型超聲檢查或hCG測定不難確診， 必要時應刮宮加以鑒別。 要特別注意肌瘤合併妊娠， 此時， 子宮較停經月份為大， 外形多不規則， 質地較硬， B型超聲檢查可協助確診。
二、卵巢腫瘤
實性卵巢腫瘤可能誤診為漿膜下肌瘤；反之， 漿膜下肌瘤囊性變也常誤診為卵巢囊腫，
三、子宮肌腺瘤
臨床上也表現為月經量增多及子宮增大， 與子宮肌瘤明顯不同處在於以痛經為主要症狀， 也常遇到痛經不明顯者而診斷為子宮肌瘤。 檢查時子宮多呈均勻性增大， 且有經期增大而經後縮小的特徵。
四、子宮肥大症
此類患者主要臨床表現也是月經增多、子宮增大， 故易與子宮肌瘤混淆。 但本症為子宮均勻增大， 且很少超過2個月妊娠子宮， B型超聲可協助診斷。
