嬰兒濕疹的病因較複雜， 其發病與多種內外因素有關， 有時很難明確具體的病因。 患兒往往由消化道攝入食物性變應原如魚、蝦、牛羊肉、雞蛋等致敏因素， 使體內發生Ⅰ型變態反應。 嬰兒濕疹的高度發病率主要是由於患兒皮膚角質層薄， 毛細血管網豐富， 以及內皮含水及氯化物較多， 因而容易發生變態反應。 此外， 機械性摩擦如唾液和溢奶經常刺激， 也是本病的誘因。 護理不當如過多使用較強的鹼性肥皂， 過高營養， 以及腸內異常發酵等也可引起本病。 有些嬰兒， 尤其在新生兒時期， 由於母體雌激素通過胎盤傳給胎兒，
有些嬰兒有遺傳過敏素質（異位性素質）， 家族中也有異位性皮炎、魚鱗病、哮喘或過敏性鼻炎等病史， 患兒對食物過敏， 血中IgE數值增高， 嗜酸細胞增高。 隨著年齡增長， 皮膚損害逐漸限局于四肢屈側處（肘窩、膕窩）， 往往劇烈抓癢、反復不愈， 直至兒童期甚至延續到成人期。 某些外在因素如日光、紫外線、寒冷、濕熱等物理因素， 接觸絲織品或人造纖維， 外用藥物以及皮膚細菌感染等， 均可引起濕疹或加重其病情。
