重症肌無力患者如果確診合併胸腺病變（胸腺瘤和胸腺增生）應早期行胸腺摘除治療， 或經臨床診斷其他類型的重症肌無力符合胸腺切除手術適應證， 也可作胸腺切除治療。
胸腺切除手術治療原則
①確診胸腺瘤患者應行胸腺切除手術， 而不考慮重症肌無力的嚴重程度， 早期手術治療可以降低腫瘤擴散的風險。
②不伴有胸腺瘤的重症肌無力患者， 輕型者不能從手術中獲益， 而相對較重患者特別是全身型合併乙醯膽鹼受體抗體陽性的重症肌無力患者則可能在手術後臨床症狀得到改善或緩解。
③MuSK抗體陽性的重症肌無力患者， 胸腺切除手術對肌無力的療效不佳；而對於乙醯膽鹼受體抗體和MuSK抗體均為陰性的全身型重症肌無力患者， 也應早期行胸腺切除手術治療。
④乙醯膽鹼受體抗體陽性且對乙醯膽鹼酯酶抑制劑治療不敏感的全身型重症肌無力患者， 也可考慮在發病1年內行胸腺切除手術。
⑤病情較重無法手術或長期使用免疫抑制藥物且不能減量患者， 術前可先作血漿交換或大劑量丙種球蛋白衝擊治療。
⑥術前應做好充分的內科治療準備， 要求重症肌無力臨床症狀相對穩定， 以免誘發肌無力危象。
⑦術前維持原有膽鹼酯酶抑制劑使用劑量， 儘量不用或少用糖皮質激素， 以免傷口感染和不易癒合。
⑧未成年重症肌無力患者胸腺切除手術仍存在爭議。
