肝癌分原發性和繼發性兩種， 繼發性肝癌系由於其它臟器的腫瘤經血液、淋巴或直接侵襲到肝臟所致。
肝癌發生的原因主要有以下幾種
(1)病毒性肝炎：主要是乙型與丙型肝炎病毒感染， 尤其是乙肝與乙肝病毒攜帶者， 其原發性肝癌的發生率要比正常人高出2～100倍；在肝癌的高發地區， 約20%的人可能是乙型肝炎或乙肝病毒攜帶者。
(2)黃麴黴毒素(AFT)：以黃麴黴素B為最重要的致癌物質。 適宜于高溫、高濕的氣候環境中生長繁殖， 尤其是夏季的黴變食物及穀物、飼料等， 最易被黃麴黴菌污染而產生黃麴黴毒素，
(3)水源污染：飲用水質的嚴重污染， 是肝癌發生的重要誘因之一， 尤其是污染的溝水， 其次為河水， 井水最低。 故在沒有自來水設施的鄉村， 應提倡飲用井水。
(4)化學致癌物質：能引起肝癌的化學物質以N-亞硝基化合物為主， 如亞硝胺和亞硝醯胺等。 此外， 農藥、酒精、黃樟素等亦均能誘發肝癌。
(5)其他因素：營養過剩(大量營養素)或營養缺乏(如維生素A、B1缺乏)、血色病、寄生蟲感染及遺傳等， 也是誘發肝癌的危險因素。
(6)免疫狀態：有人認為肝癌患者血漿中含有一種封閉因數， 能抑制細胞免疫並保護肝癌細胞不受免疫細胞殺傷。 現已證明， 甲胎蛋白(AFP)就能抑制淋巴細胞和巨噬細胞的吞噬作用。
(7)基因突變：近年來，
此外， 肝癌的發生還與非血蛋白的核蛋白對細胞週期的調控失常， 以及細胞內外因素如環核苷酸、激素、多肽、生長因數及多胺等有關。
