病毒培養是檢測HIV感染最精確的方法。 一般採取培養外周血單個核細胞（PBMC）的方法進行HIV的診斷。
病毒核酸檢測通常是通過檢測HIV RNA水準來反映病毒載量， 具有很高的靈敏度， 使用適時螢光聚合酶鏈反應（PCR）技術， 能夠在HIV感染的前2周檢測到病毒核酸。 病毒核酸檢測方法可用於HIV的早期診斷， 如視窗期輔助診斷、病程監控、指導治療方案及療效測定、預測疾病進程等。 目前常用的測定方法有逆轉錄PCR實驗（RTPCR）、核酸序列擴增實驗（NASBA）、分支DNA雜交實驗（bDNA）等。 使用高靈敏度的適時螢光PCR技術， 能夠在HIV感染的前2周檢測到病毒核酸。
病毒分類
HIV在病毒分類中屬逆轉錄病毒科慢病毒屬中的人類免疫缺陷病毒組。 迄今為止， 根據血清學反應和病毒核酸序列測定， 全球流行的HIV可分為2型：HIV1型和HIV2型。 在HIV1型內， 根據編碼包膜蛋白的env基因和編碼殼蛋白的gag基因序列的同源性又進一步分為3個組：M組（主要組）、O組（週邊組）和N組（新組或非M非O組）， M組內又可分為A？J10個亞型。 在HIV1型和HIV2型之間， 其核苷酸序列有45%的同源性， 並且存在免疫交叉反應。 應用免疫印跡法（West blot）可以將二者明確地區別開來。
