一、本病的發生， 主要是感受“瘧邪”， 但其發病與正虛抗邪能力下降有關， 誘發因素則與外感風寒， 暑濕， 飲食勞倦有關， 其中尤以暑濕誘發為最多。 夏秋暑濕當令之際， 正是蚊毒瘧邪肆虐之時， 若人體被瘧蚊叮吮， 則瘧邪入侵致病。 因飲食所傷， 脾胃受損， 痰濕內生；或起居失宜， 勞倦太過， 元氣耗傷， 營衛空虛， 瘧邪乘襲， 即可發病。
二、病機瘧疾的病位總屬少陽， 故歷來有“瘧不離少陽”之說。 感邪之後， 邪伏半表半裡營衛之間， 邪正交爭， 則瘧病發作；瘧邪伏藏， 則發作休止。 發作時， 邪入與營陰相爭， 衛陽一時不能外達，
由於感受時邪不一， 或體質有所差異， 可表現不同的病理變化。 一般以寒熱休作有時的正瘧， 臨床最為多見。 如素體陽虛寒盛， 或感受寒濕誘發， 則表現為寒多熱少的寒瘧或但寒不熱之“牝瘧”。 素體陽熱偏盛， 或感受暑熱誘發， 多表現為熱多寒少之溫瘧。 因感受山嵐瘴毒之氣而發者為瘴瘧， 可以出現神昏譫語， 痙厥等危重症狀， 甚至發生內閉外脫的嚴重後果。 若疫毒熱邪深重，
本病總因感受瘧邪所致， 故病理性質以邪實為主。 但瘧邪久留， 屢發不已， 氣血耗傷， 不時寒熱， 可成為遇勞即發的勞瘧。 或久瘧不愈， 氣血瘀滯， 痰濁凝結， 壅阻于左脅下而形成瘧母。 且常兼有氣血虧虛之象， 表現為邪實正虛。
