治療有支持性和對症性, 醫師具有同情心的理解和引導非常重要。 醫師必須解釋基礎疾病的性質, 並令人信服地向患者證實沒有器質性疾病的存在。 這就需要時間去傾聽患者訴說並向他們解釋正常腸道生理和腸道對應激食物或藥物的高敏感性。 這些解釋工作使我們有基礎嘗試重新建立腸道運動的正常規律和選擇適合於該患者的具體療法, 應該強調IBS繼續治療上的流行性, 長期性和需要, 應該尋找, 評估和治療心理應激, 焦慮和情緒異常。 有規律的體力活動有助於緩解壓力和促進腸道功能,
一般而言, 應該恢復正常飲食。 腹脹和氣脹的患者還是少食或不食豆類, 捲心菜和其他含可發酵碳水化合物的食物為宜, 少吃蘋果, 葡萄汁, 香蕉, 各種堅果和葡萄乾也可減少脹氣的發生。 對乳糖不耐受患者應減少牛奶或乳製品的攝入。 攝入山梨醇, 甘露醇, 果糖, 或山梨醇和果糖一併攝入也可使腸道功能紊亂。 山梨醇和甘露醇是一種用於營養的食物或作為藥物載體的人工加甜劑, 而果糖是水果, 漿果和植物的基本成分.餐後腹痛的患者可試用低脂高蛋白質飲食。
增加膳食纖維對許多IBS患者有利, 尤其是便秘型患者。 可給予刺激性小的食物, 如糠麩, 開始每餐15ml(1湯匙), 並隨液體攝入的增加而增加。
抗膽鹼能藥物(如莨菪堿0.125mg,餐前30~60分鐘)可以配合纖維素應用。 不主張用麻醉藥, 鎮靜劑, 催眠和其他可產生依賴性的藥物。 對於腹瀉患者, 可于餐前給予苯乙呱啶2.5~5mg(1~2片)或洛呱丁胺2~4mg(1~2粒)。 因為可以發生對止瀉效應的耐受性, 所以不主張長期應用止瀉藥。