隱睾症的睾丸在出生六個月後, 電子顯微鏡下即可發現不正常的變化;在一歲以前, 正常下降睾丸與隱睾的造精細胞數量約略相等;但是兩歲之後隱睾的造精細胞數量明顯減少, 有五分之一的隱睾已經喪失造精細胞;到了成年期, 大概所有的隱睾的造精細胞都已經消失了!另外, 兩側隱睾之不孕機率遠高於單側隱睾。
過去, 多數的專家認為應該在一歲至兩歲之間施行手術, 將未下降之睾丸拉至陰囊內, 這就是睾丸固定術。 現在有許多人基於電子顯微鏡下的不正常的變化, 認為應提早到六個月大就手術。
腹腔內隱睾症患者, 由於睾丸深藏腹腔內, 因此必須將腹腔打開找睾丸, 傳統手術傷口較大, 破壞也多。 腹腔鏡的應用避免了此一問題。 腹腔鏡可在腹腔內將血管與輸精管外之腹膜與結締組織剝離, 使血管與輸精管長度足夠帶到陰囊。 目前是腹腔內隱睾症之最佳手術選擇。 另外有少數人其實睾丸已經退化萎縮, 外觀一如普通隱睾症患者。 觸診或是其他檢查也是察覺不到睾丸,
除了手術外, 也有人用荷爾蒙來治療隱睾症。 其中較常用的是脈絡膜親生殖腺素 (human hCG) 或 LH-RH鼻噴劑。 其作用方式不外乎刺激睾丸下降, 可惜成效只有10%不到。 所幸睾丸固定術在有經驗的醫師處理下成績還算理想, 大部分病人只需門診手術不用住院。 傷口照顧也很簡單, 約一周可恢復。 手術後一個月內只需避免劇烈運動以免傷口出血受傷。 日常生活起居一如往常。 少數腹腔內隱睾症患者, 因為需將腹腔打開找睾丸, 這類病人才必須住院。
隱睾症可能發生的其他後遺症包括了睾丸惡性腫瘤、疝氣、與因為少了睾丸所引起之心理異常。
合併疝氣的隱睾症也不少見。 由於疝氣可能會造成嵌頓(即腸子卡在腹股溝, 造成血液迴圈受阻), 因此必須愈早手術解決愈好, 因此一但有合併疝氣的隱睾症, 兩者必定同時解決,
總之, 睾丸固定術對隱睾症而言, 有幾個好處:可能減少不孕症的機會, 也可能減少睾丸惡性腫瘤罹病率, 它可以解決合併發生的疝氣, 對隱睾症造成陰囊外觀異常所造成的心理問題有幫忙。 但是不要忘記, 這些好處在六個月到二歲之間手術才有。 早期發現, 早期診斷仍是避免後遺症的不二法門。