治療軟下疳要雙管齊下, 一方面進行全身治療, 一方面進行局部治療, 兩者同時進行。
殺滅杜克雷氏嗜血桿菌最有效的藥物是磺胺類和抗生素。 以複方新諾明內服為首選。 有的醫生認為複方新諾明與四環素合用, 可取得最佳效果。 也有人認為一次性肌肉注射壯觀黴素2克, 是治療軟下疳最簡便、安全的有效方法。 其他抗生素類藥, 如紅黴素、土黴素、卡那黴素、強力黴素、鏈黴素、頭孢三嗪等亦可選用, 均有較好療效。 對患處可進行局部治療, 用1:2000高錳酸鉀溶液或3%雙氧水, 每日浸泡, 然後塗上藥膏(紅黴素、金黴素、磺胺軟膏均可)。