再生障礙性貧血患者在造血幹細胞移植後, 有部分患者可能出現異體細胞對機體產生排斥, 臨床上稱為移植物抗宿主病。 移植物抗宿主病是異種基因造血幹細胞移植過程中主要的併發症之一, 臨床上表現為造血幹細胞移植後出現皮炎、肝炎、腸炎等一組臨床徵象, 一般在接受異種基因造血幹細胞移植後一百天內發生的稱為急性移植物抗宿主病, 而一百天后發生的稱為慢性移植物抗宿主病。
移植物抗宿主病是由於造血幹細胞與受著機體細胞除組織相容性抗原一致外, 還存在免疫遺傳學差異,
移植物抗宿主病主要損害的器官是皮膚、腸道和肝臟, 發病越早的患者病情越重, 其發生機制主要是由於供者的淋巴細胞對受者體內的細胞具有一定程度的攻擊作用。