就治療疾病來說， 都有其最好的治療方法， 肛瘺同樣是如此， 但是需要注意的是， 並不是越先進的技術就是越好的治療方式， 其要根據患者的病情進行治療， 就以手術來說， 其儘管先進， 但是如果是肛瘺初期， 其在治療上， 沒有必要選擇手術治療， 因此其不是最好的治療方式， 下面， 就治療肛瘺的方法總結如下：
1、瘺管切開術。 是將瘺管全部切開開放， 靠肉芽組織生長使傷口癒合的方法。 適用於低位肛瘺， 因瘺管在外括約肌深部以下。 切刀開後只損傷外括約肌皮下部和淺部， 不會出現術後肛門失禁。
2、肛瘺切除術。 切開瘺管並將瘺骨壁全部切除至健康組織， 創面不於縫合;若創面較大， 可部分縫合， 部分敞開， 填人油紗布， 使創而由底向外生長至癒合。 適用於低位單純性肛瘺。
3、掛線療法。 是利用橡皮筋或有腐蝕作用的藥線的機械性壓迫作用， 緩慢切開肛瘺的方法。 適用於距肛門3-5cm內， 有內外口低位元或高位單純性肛瘺， 或作為複雜性肛瘺切開、切除的輔助治療。
如果是採用手術治療的情況下， 術後的護理是關鍵， 尤其是手術的部位， 術後的手術部位非常容易受到各個方面細菌的侵襲， 從而發生感染， 導致疾病的引發， 這一點對於女性來說， 表現的尤其明顯。 因此， 關於這一點要重視。
