肛瘺的治療方式有很多， 一般情況下， 都是以手術治療為主， 但手術治療的方式確實不固定的， 需要根據患者的具體類型決定， 手術的關鍵是在於減少肛門括約肌部位的損傷， 防止病灶給患病部位造成的進一步傷害。 下面就肛瘺的治療方式進行介紹：
①調理排便：保持大便通暢， 防止腹瀉或便秘， 以減少糞便對肛瘺內口的刺激。
②清潔肛門：每日用溫鹽水或高錳酸鉀1：10000的溶液坐浴1～2次。 且要勤換內褲。
③適當用藥：可適當使用黃連素， 慶大黴素等抗生素口服， 以控制炎症。 也可適當使用藥膏等局部塗抹或中藥內服外用。
如果肛瘺比較嚴重就必須要考慮手術方法治療了。 肛瘺手術治療方法比較多， 大致歸納為以下幾種：
①肛瘺切開和切除術：手術的目的是將肛瘺的內口， 瘺管， 外口， 支管和瘢痕組織切開或切除。
②切斷肛管直腸環和括約肌。 此手術可造成肛門失禁， 因此， 要注意操作。
③傷口一期植皮：切除瘺管， 內口， 止血修整傷口後， 以溫鹽水沖洗傷口， 取薄皮片覆蓋於傷口之上， 並間斷縫合， 加壓包紮， 並控制大便排泄。
④掛線療法：即將膠圈由外口穿過瘺管， 從內口穿出， 緊緊結紮， 使瘺管壁發生壞死， 成為開放性傷口， 達到治癒的目的。
⑤藥撚療法：用清熱解毒， 祛腐生肌的中藥做成藥撚， 從瘺外口插入， 使瘺管痊癒。
⑥姑息切除術：該手術不切斷外括約肌，
肛瘺與癌症沒有直接的聯繫， 因為肛瘺並不是癌症的前期病變， 但需要注意的是， 臨床上也確實存在由肛瘺轉化為癌症的病例， 但非常少見， 可以說， 轉化為癌症的是非常低的， 但也不要大意， 還是以及時治療為主。
