肝癌發生的原因主要由以下六種“罪行”所導致：
1、水源污染：飲用水質的嚴重污染， 是肝癌發生的重要誘因之一， 尤其是污染的溝水， 其次為河水， 井水最低。 故在沒有自來水設施的鄉村， 應提倡飲用井水。
2、病毒性肝炎：主要是乙型與丙型肝炎病毒感染， 尤其是乙肝與乙肝病毒攜帶者， 其原發性肝癌的發生率要比正常人高出2～100倍;在肝癌的高發地區， 約20%的人可能是乙型肝炎或乙肝病毒攜帶者。
3、黃麴黴毒素（AFT）： 以黃麴黴素B為最重要的致癌物質。 適宜于高溫、高濕的氣候環境中生長繁殖， 尤其是夏季的黴變食物及穀物、飼料等，
4、化學致癌物質：能引起肝癌的化學物質以N-亞硝基化合物為主， 如亞硝胺和亞硝醯胺等。 此外， 農藥、酒精、黃樟素等亦均能誘發肝癌。
5、基因突變：還有人認為， 環境中的突變原和病毒作用激發肝細胞分裂反應途徑的活化， 引起細胞的點突變和基因易位， 是加速癌細胞增殖的可能因素。
6、免疫狀態：有人認為肝癌患者血漿中含有一種封閉因數， 能抑制細胞免疫並保護肝癌細胞不受免疫細胞殺傷。 研究已證明， 甲胎蛋白（AFP）就能抑制淋巴細胞和巨噬細胞的吞噬作用。
