兒童齲齒疾病的治療方法主要有充填方法。 即將齲壞組織去除淨， 作成一定的洞形， 清洗、消毒以後， 用充填材料（filling materrial）填初， 並恢復牙齒缺損的外形， 齡壞即可不繼續發展。 淺齲充填效果最好。 中齲和深齲的治療， 在去淨齲壞組織以後， 有時洞底已接近牙髓， 就需要在洞底加一層護髓劑再填初。 有時深齲在去淨齲壞組織以後牙髓就暴露了， 就需要先採取牙髓治療， 然後才能填初。 充填材料主要用銀汞合金（amalgam）或複合充填樹脂（composite resin）。 乳牙因要換牙， 可以用玻璃離子水門汀（glass sonomer cement）填補（暫時性充填材料）。
如果沒有形成齲洞的衩期齲， 可以用藥物治療的方法， 能達到一定的療效。 恒虐待常用氟化鈉糊劑塗擦齲損;乳牙可用氟化雙胺銀（塗擦後有變色， 故不用於恒牙）。 塗藥治療後， 仍可能復發， 需要每半年複查一次。 因此， 治療齲齒， 愈早愈好。
在兒童齲齒的治療過程中， 家長不僅要配合醫生， 還應該鼓勵孩子配合醫生， 牙齒剛剛補好時， 可以吃一些軟的食物， 第二天便可以正常使用。
專家提醒：患者如病情嚴重請及時就醫。
兒童齲齒容易誘發牙髓炎， 牙髓炎疾病如不及時治療的話會引起根尖周炎， 為了避免更多疾病的併發， 及時治療兒童齲齒是很重要的。
