1、感染因素：如果某些患者有肛門疾病或感染， 就很容易造成肛裂的發生。 齒狀線附近的慢性炎症， 如後正中處的肛竇炎， 向下蔓延而致皮下膿腫， 破潰而成為慢性潰瘍；肛管損傷後亦難癒合的原因至今不明， 有人認為主要是損傷合併感染所致， 感染時炎性細胞可以釋放溶膠原酶， 阻止上皮組織再生與延伸。
2、飲食因素：生活好了， 飲食越來越多樣化， 這也讓我們的飲食越發的不規律。 如食物品質的精粗， 蔬菜種類的改變與量的增減， 蛋白質、脂肪、澱粉、纖維素等含量的多少， 水分攝人情況， 都能直接影響糞便成分，
除此之外， 解剖因素以及內括約肌緊張因素也可以導致肛裂的發生。
1、解剖因素：肛管外括約肌淺部在肛門後方形成肛尾韌帶， 較堅硬， 伸縮性差；肛提肌大部分附著于肛管兩側， 因此肛管前部和後部不如兩側堅強， 容易損傷；肛管和直腸形成肛管直腸角， 使肛管後部承受糞便壓力大等都是造成肛裂的因素。
2、內括約肌緊張：肛裂患者有不正常的內括約肌過度收縮現象。 反射性內括約肌痙攣目前認為是肛裂不易癒合的重要原因。
