丙肝的抗病毒治療主要依靠干擾素。 目前， 長效干擾素PEG-IFNα聯合應用利巴韋林是慢性丙型肝炎治療的標準方案。 兒童是丙型肝炎的易感人群之一。 將干擾素應用于兒童的丙肝治療時， 需要注意一些嚴重的不良反應， 謹慎用藥。
骨髓抑制
長期應用干擾素治療會抑制丙肝患者的骨髓造血功能， 使得血液中血小板以及白細胞數目減少， 引發造血異常病症。 所以， 應用干擾素治療小兒丙肝時， 需要嚴密觀察血象變化。 當白細胞計數出血傾向。 血象恢復後可重新開始干擾素治療， 但仍需密切觀察。
骨骼發育受限
兒科研究丙型肝炎試驗的隨訪研究表明， 用聚乙二醇干擾素α治療兒童丙型肝炎， 會使患兒的身高， 體重， 身體品質指數有明顯改變。 這可能與長效干擾素造成的生長激素分泌不足有關。 所以儘量不要使用長效干擾素治療小兒丙肝， 如果不得已使用的話， 一定要控制用藥量。
誘發其他疾病
應用干擾素可誘發心律不齊、心肌缺血等心臟病， 需要定期為接受治療的患兒檢查心電圖。 同時， 干擾素還可引起抑鬱、焦慮等精神障礙， 當發現患兒出現情緒改變時， 需要及時進行心理測試， 給予心理治療。 若出現嚴重精神症狀， 需要立刻停用干擾素， 積極治療精神病。
