兒童偏頭痛的臨床表現與成人相似， 主要表現為伴或不伴先兆的頭痛， 部分患兒可有噁心、嘔吐、畏光等症狀， 休息或睡眠後可緩解。 兒童偏頭痛常有一些頭痛症狀外的症狀， 根據表現的不同可分為以下變異型。
1、偏癱型偏頭痛
常呈家族顯性遺傳， 表現為偏癱， 伴或不伴語言障礙， 頭痛症狀不明顯， 可持續數分鐘至數小時。 首次發作多不能診斷， 對反復的、同一形式的發作、並且間歇期完全正常的患兒可以診斷。
2、意識混亂型偏頭痛
僅見于幼兒， 青春期及成人後幾乎不見， 表現為一種週期性混亂和方向感喪失、伴或不伴激動，
3、基底型偏頭痛
多見於青春期女孩， 頭痛輕微， 先兆後出現眩暈、暈厥和運動性構音障礙， 排除心源性或血管迷走神經性暈厥、內耳疾病、後顱窩腫瘤等情況後可診斷。
4、兒童期良性陣發性眩暈
表現為短暫的眩暈發作， 患兒不能描述症狀， 但典型表現是緊貼父母、看起來很驚恐， 多不伴頭痛， 後期轉為典型偏頭痛。
5、眼肌麻痹型偏頭痛
兒童期發病， 急性眼運動障礙， 單側瞳孔反射異常， 可與癲癇同時存在， 需要仔細鑒別， 對反復多次發作、嚴重發作、間歇期明確的患兒可診斷。
