起病多數緩慢、病程呈慢性隱匿過程, 有活動期和緩解期相交替的趨勢。 少數為急性起病, 可表現為急腹症、腸穿孔、腸梗阻等。
一、腹痛 是最常見的症狀, 多位於右下腹或臍周, 一般為中等度疼痛, 呈痙攣性, 餐後加重, 禁食、休息、局部熱敷可減輕。 如炎症波及腹膜或急性腸穿孔時可出現全腹劇痛, 呈急性腹膜炎表現。
二、腹瀉 糞便呈糊狀, 一般每日3-4次, 常無膿血及粘液, 病變位於結腸遠端常有粘液血便。
三、腹塊 由於腸壁或腸系膜增厚、腸粘連、腸系膜淋巴結腫大, 內瘺或局部膿腫形成, 故常可於右下腹捫及包塊,
四、瘺管形成 為本病的特徵性體征。
五、肛門直腸周圍病變。
六、全身表現 約三分之一的病人有間歇性低熱或中等度發熱, 偶有高熱。 嚴重者可有貧血、消瘦、低蛋白血症及水電解質紊亂。
七、腸外表現 部分病人有鵝口瘡性口炎、結節性紅斑、杵狀指、皮膚潰瘍、關節炎和肝腫大等。