一般， 治療膀胱炎主要是以藥物治療措施為主， 但需要注意的是， 抗菌藥物的選擇一定要明確致病菌， 若是盲目應用的情況下， 這樣很難治癒疾病， 並且即便是有一定的治療效果， 也會再一次的復發。 下面就藥物治療膀胱炎的方式進行具體介紹：
1.首次發作時， 醫生會給患者使用抗生素， 如諾氟沙星、複方新諾明、阿莫西林、呋喃西林等。 患者用藥3～7天后大多可治癒。 若膀胱炎反復發作， 醫生則會 讓患者先做尿細菌培養及藥物敏感試驗， 根據藥敏情況使用抗生素。 對於老年， 醫生大多會給他們選用那些在腎組織及尿液中藥物濃度高、腎毒性小的藥物，
2.若感染反復發作， 療效不佳， 醫生會檢查患者的免疫功能。 若患者免疫功能低下， 醫生會給患者服用免疫增強藥物， 如中藥玉屏風散。 患者也可採用自然療法如練習氣功、太極拳等， 以增強機體的抗病能力。
3.若患者久治不愈或反復發作， 醫生會考慮作相應檢查， 以排除其他疾病， 如尿道口附近是否有感染， 是否有尿路梗阻， 有無全身性疾病。 經抗生素治療後療效不佳的患者， 醫生還會進行其他病原體檢查， 如支原體、衣原體、真菌 等。
需要注意的是， 有些患者的致病因素並不是非常明確的，
