長期抗病毒治療是慢性乙肝治療的核心， 但目前乙肝患者自行停藥、間斷服藥或換藥等主觀因素是導致療效不佳的主要原因。
過去幾年， 乙型肝炎抗病毒治療的臨床實踐取得了豐富的臨床證據， 臨床醫生抗病毒用藥的水準有很大的提高。
醫生在臨床實踐中發現， 同樣的慢性乙型肝炎患者、藥物和治療方案， 最終療效卻完全不一樣， 分析影響抗病毒治療療效以及耐藥的因素後， 醫生用藥就變得聰明很多， 這就是臨床的進步， 有兩個非常突出的標誌：
第一個就是慢性乙肝的優化治療。 臨床醫生根據抗病毒治療過程中某些指標的變化規律， 預測未來的療效， 採取不同的措施提高抗病毒治療的療效。 具體來說， 在抗病毒治療之後的第24周， HBV DNA（乙肝病毒的去氧核糖核酸， 即乙肝病毒基因）如果檢測不到， 那麼這些病人就應該沿用以前的治療藥物和治療方案繼續治療;如果HBV DNA下降的不是很滿意， 這些患者就應該加上一種藥進行聯合抗病毒治療， 提高療效， 這就是優化治療的概念。
第二個就是關於慢性乙肝治療的停藥問題。 醫生能夠根據抗病毒治療的療效來決定抗病毒的療程， 並不像當初所有的病人都要經過長期或者終身治療。 口服抗病毒藥物一般都需要長期的抗病毒治療，
