尖銳濕疣的治療一般分為藥物治療和物理治療， 其中藥物治療適用於較小疣體， 尤其是疣體數目較多的情況採用藥物治療比物理治療具有很大的優勢， 而對於大於較大的疣體如使用藥物治療， 則治療時間較長， 患者多不願接受。
1、藥物治療給患者帶來的痛苦要比物理治療小一些。 物理治療在臨床上用得多的為鐳射治療， 鐳射治療術前要注射麻藥， 治療時用高能雷射光束燒焦疣體， 使其碳化， 數天后焦化疣體脫落。 因外☆禁☆陰部神經豐富， 患者通常要忍受比較強烈的疼痛;相對於鐳射治療， 藥物治療所帶來的痛苦要小得多，
2、藥物治療恢復時間短。 物理治療從治療開始-創面完全癒合-創面處皮膚恢復正常， 整個過程約需要20天左右， 而藥物治療整個過程只需要幾天時間。 藥物治療對皮膚的損傷要小一些， 疣體脫落後創面恢復時間短， 一般只須1-3天。 治療後創面恢復時間越長， 說明所受損傷越嚴重。
3、藥物治療後發生感染、留疤痕的可能性要比物理治療小。 而發生感染則容易引起下一次尖銳濕疣復發， 這也是物理治療容易復發的原因之一。
4、藥物治療在去除疣體以後， 還可以治療疣體周圍的病毒感染即尖銳濕疣亞臨床感染，
以上的這些有點都是建立在正確的使用方法基礎上， 如某些患者治療心切急於求成， 擅自加大塗藥量， 則可能造成不應有的副作用。 因此尖銳濕疣藥物治療一定要在專業人士的協助下， 制定適合自己的用藥方案， 堅持按療程用藥治療。
