再生障礙性貧血患者由於多病因導致的骨髓造血功能低下， 常伴有外周血白細胞計數減少， 白細胞是人體抵禦外界病原菌的重要組織， 白細胞減少會導致嚴重的感染。 因此， 再生障礙性貧血患者應做好防護， 有感染跡象時應及時抗菌治療。
再生障礙性貧血患者日常要做好個人衛生， 對白細胞缺乏者應盡可能入住無菌層流室， 做好室內消毒， 加強口腔和肛門的無菌護理， 每日應用漱口水漱口以減少口腔感染的機會。 患者進食的食物應注意清潔衛生， 防止消化道感染， 日常應多飲水， 保持足夠的尿量沖刷尿道，
感染的常見部位為呼吸道、消化道、皮膚黏膜及泌尿道，
感染的細菌包括革蘭氏陰性菌、革蘭氏陽性菌，
球菌、桿菌等，
如大腸桿菌、肺炎球菌、綠膿桿菌、表皮葡萄球菌。
局部感染會由於未能及時控制而擴展至全身，
引發膿毒血症、敗血症等。
部分患者還可能合併厭氧菌及真菌感染。
再障患者出現感染跡象後應立即進行檢查，
確定感染部位和病原菌。
在未找到明確致病菌之前，
可以經驗性選擇高效抗生素，
以後再根據病原菌及藥敏試驗結果進行調整。
患者應用抗生素應早期、足量、聯合，
確保抗感染療效。
