前列腺結核的治療和全身結核病的治療方法相同， 必須包括全身治療和抗癆藥物治療。 前列腺結核用抗癆藥物治療有較好的效果。 治療方法與腎結核的治療相同， 採用以異煙肼、鏈黴素、利福平等為主的兩種或三種藥物聯合應用。 一般經驗認為， 治療療程為6～12個月。
治癒的標準是尿液或前列腺液結核菌塗片和培養均為陰性， 泌尿生殖系統結核症狀及體征全部消失。
1）一般治療：
包括休息、適當營養、避免勞累等
2）藥物治療：
前列腺結核藥物治療效果較好。 用藥時間6個月， 也可按前列腺液、精液結核桿菌培養結果來幫助估計用藥期限。
3）手術治療：
前列腺結核一般不主張作前列腺切除術， 因為現代抗癆藥物治療大多能控制病變， 而且這類手術需將前列腺連同附睾、輸精管、精囊等一併切除， 手術範圍大， 有一定危險， 甚至術後會引起結核性會陰尿道瘺， 傷口不癒合。 只有當前列腺結核嚴重、廣泛空洞形成、乾酪樣變性或造成尿路梗阻， 用一般藥物治療不能緩解時， 或者前列腺結核寒性膿腫已引起尿道、會陰部賽道時， 可考慮作前列腺切除術。
前列腺結核伴有附睾結核的病例， 如果藥物治療無效，
