隱球菌病的常見症狀是， 容易導致機體免疫力下降， 而這個時候更會造成一些病原菌入侵而引起血行傳播， 患者容易表現出噁心嘔吐， 智力減退或者是暈眩等等這些症狀。
（1）肺隱球菌病 環境中存在的新生隱球菌直徑小於10μm， 經呼吸道吸入人體後， 一旦其沉積在呼吸道中， 在較高的二氧化碳濃度的影響下， 形成明顯的多糖莢膜保護層以拮抗宿主的防禦機制。 多數健康人感染可以自愈或病變局限於肺部。 在免疫功能受損的患者， 隱球菌能夠進展活動， 可引起嚴重肺部感染甚至經血行播散全身。
（2）中樞神經系統隱球菌病 患者常訴前額、雙顳或眼球後疼痛， 間歇發作， 疼痛逐漸加重， 多伴有發熱及頸強直、抬頸抬腿試驗陽性等腦膜刺激征。 若發生腦實質局限性肉芽腫， 出現單純占位性病變， 可出現噁心、嘔吐、智力減退、昏迷、偏癱、視物模糊、眩暈、眼球麻痹、眼球震顫、複視等症狀。 精神障礙可很顯著。 亦可出現癲癇樣發作。 本病常發生于愛滋病患者，
（3）皮膚黏膜隱球菌病 隱球菌的皮膚感染最多見於頭頸部， 常因原發灶的播散引起。 皮疹表現為丘疹、痤瘡樣膿皰或膿腫， 易潰爛。 部分HIV感染者將發生傳染性軟疣樣皮損。 皮膚的原發損害較罕見， 表現為孤立的瘭疽， 須依據明確的植入史及可疑植入物中培養出隱球菌才能確診。 部分患者可同時因累及黏膜而呈結節性、肉芽腫性或潰瘍性損害。 （
