輔助檢查對腦癱的病因診斷、鑒別診斷和判斷預後等都有重要意義， 必要的輔助檢查有以下幾個方面：
腦電圖：約有80%的腦癱患兒有腦電波異常其中偏高， 也有可能正常， 也可表現異常背景活動， 伴有癲癇性放電波者應注意合併癲癇的可能性。
腦電地形圖：檢測患兒腦發育與腦波變化。
腦磁圖。
誘發電位：視力減退或聽力障礙者可分別給予視誘發電位和聽誘發電位檢查。
肌電圖：瞭解肌肉和神經的功能狀態， 小兒腦癱合併肌萎縮者盡可能做此檢查。
腦阻抗血流圖：檢查腦部血管功能和供血情況。
頭顱CT、MRI檢查：1/2～2/3的患兒可有異常， 但CT、MRI檢查結果正常者不能否定小兒腦癱的診斷， 大多數腦癱患者在腦損傷早期可發現缺氧缺血性腦病、顱內出血、腦水腫等；腦損傷急性期後可發現腦萎縮、外部性腦積水、腦軟化或其他腦部隕害。
頭顱超聲波：對前囟門末閉合的小兒， 可以利用超聲波檢查， 也可以有效發現缺氧缺血性腦病、顱內出血、腦水腫、腦萎縮、外部性腦積水、腦軟化或其他畸形。
智能測定：可發現腦癱患兒是否合併智力低下。
血尿氨基酸分析：尿氣相色譜順譜分析、肝腎功能、血糖、電解質、甲狀腺功能等檢查， 可對不明原因的智力運動發育遲緩的嬰幼兒進行遺傳代謝病的篩查。
