系統性硬皮病除皮膚外可累及內臟器官。 受累的器官均有小血管病變， 管壁纖維化增厚， 管腔狹窄甚至閉塞。 肢端， 尤其是兩手的小動脈陣發性痙攣， 皮膚蒼白、發涼， 以後青紫、發紅並漸恢復正常， 伴陣發性疼痛常為本病的早期症狀， 也可伴有關節痛。 具體可有以下症狀：
1.皮膚硬化常先累及雙手及面部， 局部先腫脹， 以後發硬， 捏之不起皺紋;
2.指甲變小， 指腹萎縮， 手指末節可縮短;
3.皮膚硬化可逐漸向臂部及軀幹發展， 下肢較少受累;
4.面部可呈典型的硬皮病面容：面部發緊、發亮、無皺紋， 鼻尖， 唇薄， 張口受限，
5.軀幹上方可有色素沉著及色素減退斑;
6.內臟器官中以食管最易受累， 表現吞咽困難， 鋇餐造影可見約75%患者表現食管上段擴張， 下段狹窄， 蠕動減少， 有時胃腸道也有類似改變;病理檢查可見食管下2/3和胃腸道粘膜下纖維組織增生及慢性炎症浸潤;
7.肺部受累可表現為間質性肺炎、肺纖維化及肺動能減低， 尤其是彌散功能減低;
8.心臟受累則可有心律失常， 心臟擴大， 甚至左心衰竭;
9.腎臟受累不多見， 一般出現於疾病的晚期， 可出現惡性高血壓或急性腎功能衰竭。
